经厦门大学医学与生命科学学部研究同意,厦门大学医学院、厦门大学健康医疗大数据国家研究院于2021年12月1日正式成立医学统计支持平台。医学统计支持办公室以医学院、大数据研究院相关课题组为基础,向全校相关领域的师生及各附属医院医生提供支持服务,旨在帮助大家解决科学研究、文章撰写及基金申报过程中遇到的各种统计学及生物信息学问题。现将医学统计支持办公室相关情况介绍如下:
1、服务内容
(1)数据分析:主要包括实验数据整理、统计分析、高通量测序分析、图表的设计绘制及相关说明。
(2)咨询服务:主要包括统计方法的咨询、图表设计、样本量计算、XMBD科研大数据平台介绍使用、SPSS的使用等。
(3)分析报告:主要包括数据结果的总结、科研论文方法部分的撰写等。
2、团队组成
统计支持办公室主要负责人为李奇渊教授,目前工作人员为周颖实验师、钟桃玲助理实验师、秦青青博士后和分析人员为任君博士生、赵佳琳、胡杰硕士生共6人。
3、服务流程及人员分工
项目由前台人员接洽并评估后,转由负责的老师安排具体的分析工作。具体人员分工如下:
(1)李奇渊教授(研究规划,方法论);
(2)周颖实验师(生物信息、统计分析、实验设计咨询、Prism, 分析报告、科研论文方法部分的撰写等);
(3)钟桃玲助理实验师(医学统计分析,图表绘制,SPSS);
(4)秦青青博士后(XMBD科研大数据平台)
(5)任君博士后(项目前台,高通量测序分析)
4、收费标准
工单计算方式:根据样本的数据量和所做的分析内容来计算工单数,一个工单为300元/人时(1人时为1个分析人员1小时的时间)。其中人时包括了处理和分析样本的时间以及沟通讨论课题的时间,样本数据量越大处理的时间越长(统计实验室不收取服务器运算和存储的费用)。
收费标准示例:
单细胞测序样本:
(1) 基本分析:序列比对、质控、聚类以及注释,其中细胞类型的注释需提供针对性的标记基因。工单数依据样本的数据量大小计算,每个样本约1-2个工单。
(2) 高级分析:包括但不仅限于伪时间轨迹分析、空间转录组分析、细胞间通讯、差异基因分析、通路富集分析、共表达分析、蛋白质互作分析、转录因子分析等。工单数根据具体需求评估。
组织水平的RNA测序样本:可分析内容包括但不仅限于:比对,质控,差异基因分析,通路富集分析,共表达分析(多样本)等。工单数按照样本量、数据量和分析的具体内容评估。
ChIP-Seq/RIP-Seq/CUT&Tag样本:可分析内容包括但不仅限于:原始测序数据的过滤,比对,峰值信息的统计、差异分析以及注释等。工单数依据每个样本的数据量大小计算,每个样本约1-2个工单。
医学统计分析:根据分析的内容按照1人时=一个工单=300元/人时(1人时为1个分析人员1小时的时间)来计算。
项目收费明细详见附件。
5、联系方式
地点:医学院爱礼楼201
前台电话:任君 18030257072
邮箱:trans_medxmu@126.com
6、预约指南
(1)登录厦门大学生物医学仪器共享平台http://lifefacility.xmu.edu.cn
(2) 在搜索栏输入“XMBD”
(3)点击送样预约
(4)填写委托预约:
预约标题:请填写课题名称
计费规则:选择厦门大学医学统计支持平台服务收费标准(版本1)
预约备注:填写需要服务的内容
送样人:填写委托人的名字
送样时间:填写送样当天的时间
样品名称:可填写课题名称后面加上编号
样品数量:填写需消耗的工单数,一个工单数为300/样品,若不确定请联系对接的老师或发送邮件:trans_medxmu@126.com
(5)点击“保存”并提交。
附:服务委托单
工单计算方式:根据样本的数据量和所做的分析内容来计算工单数,一个工单=300元/人时((1人时为1个分析人员1小时的时间)。其中人时包括了处理和分析样本的时间以及沟通讨论课题的时间。
注:样本数据量越大处理的时间越长(统计实验室不收取服务器运算和存储的费用)。
收费标准详见以下附件: