2024年10月9日,课题组在国际知名学术期刊Cell Genomics上发表了题为“Phenome-wide association study in 25,639 pregnant Chinese women reveals loci associated with maternal comorbidities and child health”的最新研究成果,相较于癌症、心脑血管疾病等研究热点,妊娠相关的遗传学研究相对比较少,本研究揭示了孕产妇疾病和母婴合并症的关键潜在遗传因素,为孕期健康管理提供了新的视角。 全基因组关联研究(GWAS)和全表型关联研究(PheWAS)是鉴定疾病风险因素的主流方法,但是这些研究的成本往往较高。迄今为止,很少的关联研究关注孕产妇疾病和母婴合并症,尤其是关于中国人群的研究更少。无创产前检测(Non-invasive prenatal testing,NIPT)是胎儿染色体异常产前筛查的领先技术,是最成功的循环游离DNA (cfDNA)的临床应用之一。大规模的NIPT数据不仅可以低成本地提供群体基因组信息, 而且结合匹配的、结构良好的电子病例数据, 能够高效的揭示与孕产妇疾病和母婴合并症等表型的风险位点。 为此,我们团队提出了一项基于厦门大学附属厦门市妇幼保健院的无创产前检测数据和电子病例数据的中国汉族孕妇和新生儿基因组和表型组的关联研究,包括25,639名孕妇以及14,151名新生儿的数据,涵盖了5,957,600个遗传变异和317种疾病(International Classification of Diseases, ICD10)。 本研究发现了2,883个与26种母性疾病相关的风险位点,其中99.5%位于已知GWAS风险位点附近的基因组区域。根据连锁不平衡(R2>0.8),进一步确定为442个与母亲疾病相关的基因座,其中75.6%表现为多效性,50.9%位于相关疾病的致病基因区域。 为探究母体多效基因位点与新生儿表型的关系,本研究使用贝叶斯模型对母亲多效性位点进一步分析,鉴定了21个同时与母亲和新生儿疾病表型相关的遗传变异。 本研究的结果证明积累的无创产前检测(NIPT)数据进行全基因组(GWAS)和全表型组(PheWAS)关联研究的重要性,同时揭示孕产妇疾病和母婴合并症的关键潜在遗传因素。本研究结果是对现有的全基因组(GWAS)和全表型组(PheWAS)的结果重要补充,有助于促进制定更有针对性和个性化的产前护理和儿科预防策略,最终改善孕产妇和新生儿的健康结果。 郭金涛博士后,厦门大学附属妇女儿童医院副教授郭奇伟为共同第一作者;厦门大学医学院、健康医疗大数据国家研究院李奇渊教授,厦门大学附属妇女儿童医院周裕林教授为共同通讯作者。相关工作得到了国家自然科学基金(No. 82203420)、国家重点科研和发展计划项目(No. 2022YFA1303200,2022YFA1303201)、福建省项目重大科技项目(No. 2021YZ034011)、福建省卫健委科研项目(No. 2021ZD01002)等5项基金的资助。 Cell Genomics同期还配发了作者访谈,专辑论文的12位主要作者对母婴健康遗传学研究的未来进行了展望。总而言之,这一系列研究全面揭示了孕期表型、血糖特征及营养代谢物的遗传基础,丰富了亚洲母婴人群相关遗传学研究。 相关链接: 论文:https://www.cell.com/cell-genomics/fulltext/S2666-979X(24)00236-2 |